復(fù)旦大學(xué)現(xiàn)有哲學(xué)學(xué)院、外文學(xué)院、新聞學(xué)院、法學(xué)院、國際關(guān)系與公共事務(wù)學(xué)院、社會發(fā)展與公共政策學(xué)院、經(jīng)濟學(xué)院、管理學(xué)院、數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院、生命科學(xué)學(xué)院、信息科學(xué)與工程學(xué)院、計算機科學(xué)技術(shù)學(xué)院、上海醫(yī)學(xué)院、公共衛(wèi)生學(xué)院、藥學(xué)院和護理學(xué)院等16個全日制學(xué)院（含70個系），中國語言文學(xué)系、歷史學(xué)系、文物與博物館學(xué)系、旅游學(xué)系、藝術(shù)設(shè)計系、物理學(xué)系、化學(xué)系、力學(xué)與工程科學(xué)系、光源與照明工程系、材料科學(xué)系、高分子科學(xué)系、環(huán)境科學(xué)與工程系等12個系，以及體育教學(xué)部、社會科學(xué)基礎(chǔ)部等公共教學(xué)部門和復(fù)旦學(xué)院。

共設(shè)有本科專業(yè)70個，一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點24個，博士學(xué)位授權(quán)學(xué)科、專業(yè)點153個（其中自設(shè)29個，專業(yè)學(xué)位1個），碩士學(xué)位授權(quán)學(xué)科、專業(yè)點225個（其中自設(shè)50個，專業(yè)學(xué)位8個），并設(shè)有25個博士后科研流動站。學(xué)校還擁有中山醫(yī)院、華山醫(yī)院、眼耳鼻喉科醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、婦產(chǎn)科醫(yī)院、兒科醫(yī)院、華東醫(yī)院、金山醫(yī)院、上海市第五人民醫(yī)院、上海市公共衛(wèi)生臨床中心等10個附屬醫(yī)院。此外，學(xué)校還與有關(guān)機構(gòu)合作舉辦了復(fù)旦大學(xué)太平洋金融學(xué)院 、復(fù)旦大學(xué)上海視覺藝術(shù)學(xué)院等2所獨立二級學(xué)院。教育學(xué)校學(xué)科門類齊全，涵蓋了哲學(xué)、教育學(xué)、經(jīng)濟學(xué)、法學(xué)、文學(xué)、歷史學(xué)、理學(xué)、工學(xué)、管理學(xué)和醫(yī)學(xué)等十大學(xué)科門類。現(xiàn)有哲學(xué)、理論經(jīng)濟學(xué)、中國語言文學(xué)、新聞傳播學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)、電子科學(xué)與技術(shù)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合等11個一級學(xué)科國家重點學(xué)科；金融學(xué)、產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟學(xué)、政治學(xué)理論、國際關(guān)系、中國近現(xiàn)代史、歷史地理學(xué)、計算機軟件與理論、內(nèi)科學(xué)（心血管、傳染病、腎病）、兒科學(xué)、神經(jīng)病學(xué)、影像醫(yī)學(xué)與核醫(yī)學(xué)、外科學(xué)、婦產(chǎn)科學(xué)、眼科學(xué)、耳鼻咽喉科學(xué)、腫瘤學(xué)、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學(xué)、藥劑學(xué)、社會醫(yī)學(xué)與衛(wèi)生事業(yè)管理等19個二級學(xué)科國家重點學(xué)科，被重點學(xué)科覆蓋的二級學(xué)科總數(shù)達86個，居全國第三位。學(xué)校現(xiàn)有中國語言文學(xué)研究所、中國社會主義市場經(jīng)濟研究中心、美國研究中心、歷史地理研究所、人口研究所、世界經(jīng)濟研究所、金融研究院、數(shù)學(xué)研究所、現(xiàn)代物理研究所、遺傳學(xué)研究所、上海市心血管病研究所、上海市放射醫(yī)學(xué)研究所、肝癌研究所等306個各類研究機構(gòu)，有先進光子學(xué)材料與器件、專用集成電路與系統(tǒng)、應(yīng)用表面物理、遺傳工程、醫(yī)學(xué)神經(jīng)生物學(xué)等5個國家重點實驗室，省、部級研究機構(gòu)39個。2006年底，學(xué)校有各類學(xué)生39795人，其中博士研究生3974人（含留學(xué)生81人）、碩士研究生8235人（含留學(xué)生152人）、普通本科生15790人（含留學(xué)生1610人）、?？疲ǜ呗殻┥?36人、成人教育本?？粕?1160人。學(xué)校擁有一支高水平的師資隊伍，現(xiàn)有專任教師與科研人員2481人，其中教授、副教授近1400人，中國科學(xué)院、中國工程院院士35人（含雙聘），博士生導(dǎo)師831人，教育部“長江學(xué)者獎勵計劃”特聘教授40人、講座教授14人，“國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃（簡稱973）”項目首席科學(xué)家9人，“***有突出貢獻中青年專家”33人。