東京大學設立的學系主要有：法學部、醫(yī)學部、工學部、文學部、理學部、農學部、經(jīng)濟學部、教養(yǎng)學部、教育學部。

研究生學系主要包括：人文社會系研究科、理學系研究科、數(shù)理科學研究科、教育學研究科、工學系研究科、新領域創(chuàng)成科學研究科、法學政治學研究科、農學生命科學研究科、情報理工學系研究科、經(jīng)濟學研究科、醫(yī)學系研究情報學科、情報學環(huán)學際情報學府、綜合文化研究科、藥學系研究科、公共政策大學院。材料補充：東京大學的專業(yè)主要有：法學部：私法、公法、政治。醫(yī)學部：醫(yī)學科、健康綜合科。工學部：社會基礎學科、都市工學科、機械情報工學科精密工學科、電氣電子工學科、計數(shù)工學科、應用化學科、化學生命工學科、建筑學科、機械工學科航空宇宙工學科、電子情報工學科、物理工學科、材料工學科、化學系統(tǒng)工學科、系統(tǒng)創(chuàng)成學科。文學部：思想文化學科、言語文化學科、歷史文化學科、行動文化學科。理學部：數(shù)學科、物理學科、地球行星學科、化學科、生物學科、情報科學科、天文學科、地球環(huán)境學科、生物化學科、生物情報科學科。農學部：應用生命科學課程、獸醫(yī)學課程、環(huán)境資源學課程。經(jīng)濟學部：經(jīng)濟學科、金融學科、經(jīng)管學科。教養(yǎng)學部：超域文化科學科、綜合社會科學科、廣域科學科、地域文化研究學科、基礎科學科、生命?認知科學科。教育學部：綜合教育科學科。藥學部：藥學科。