該院歷史可追溯到1909年廣東勸業(yè)道陳望曾開設(shè)的農(nóng)事試驗場，該場于1911年春開始招收第一批林科班，學制三年，這是廣東高等林業(yè)教育的起源。

1952年華南農(nóng)學院成立，設(shè)立林學系。1963年經(jīng)國務(wù)院批準，華南農(nóng)學院林學系和湖南林學院合并成立中南林學院。1970年中南林學院再度與華南農(nóng)學院合并，成立廣東農(nóng)林學院，下設(shè)林學系和森工系。1988年10月，經(jīng)農(nóng)業(yè)部和廣東省委省政府批準，實行省部共建，將原華南農(nóng)業(yè)大學林學系改制為華南農(nóng)業(yè)大學林學院。