一、培養(yǎng)要求不同。

工學(xué)碩士：統(tǒng)招工科類研究生，側(cè)重于基礎(chǔ)理論學(xué)習(xí)和學(xué)術(shù)研究。

理學(xué)碩士：專攻理科方向（如數(shù)學(xué)、物理、力學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)、天文學(xué)、地學(xué)等專業(yè)）的碩士研究生。

二、所屬科別不同。

工學(xué)碩士：工學(xué)碩士招收的是工科類專業(yè)的本科生。

理學(xué)碩士：理學(xué)碩士招收的是理科類專業(yè)的本科生。

擴(kuò)展資料：

工學(xué)碩士的專業(yè)學(xué)位與學(xué)術(shù)型學(xué)位處于同一層次，培養(yǎng)規(guī)格各有側(cè)重，在培養(yǎng)目標(biāo)上有明顯差異。

學(xué)術(shù)型學(xué)位按學(xué)科設(shè)立，其以學(xué)術(shù)研究為導(dǎo)向，偏重理論和研究，培養(yǎng)大學(xué)教師和科研機(jī)構(gòu)的研究人員。

而專業(yè)學(xué)位以專業(yè)實(shí)踐為導(dǎo)向，重視實(shí)踐和應(yīng)用，培養(yǎng)在專業(yè)和專門技術(shù)上受到正規(guī)的、高水平訓(xùn)練的高層次人才。

專業(yè)學(xué)位教育的突出特點(diǎn)是學(xué)術(shù)型與職業(yè)性緊密結(jié)合，獲得專業(yè)學(xué)位的人，主要不是從事學(xué)術(shù)研究，而是從事具有明顯職業(yè)背景的工作，如工程師、醫(yī)師、教師、律師、會計(jì)師等。

專業(yè)學(xué)位與學(xué)術(shù)型學(xué)位在培養(yǎng)目標(biāo)上各自有明確的定位，因此，在教學(xué)方法、教學(xué)內(nèi)容、授予學(xué)位的標(biāo)準(zhǔn)和要求等方面均有所不同。

參考資料：

百度百科-理學(xué)碩士

百度百科-工學(xué)碩士