1、學費大學院(研究生院)：日本國立大學院，約75.5萬日元;日本公立大學院(平均)約82萬日元;日本私立大學院：人文科學，約101萬日元;社會科學，約103萬日元;醫(yī)、牙學，約109萬日元;農(nóng)學、藥學，約115萬日元。
2、學雜費一般情況下，報名費9800日元、入學金84600日元、研究料(學費)35萬日元/年，共計約44萬日元。
3、醫(yī)療費學生在日本留學一年以上必須入國民健康保險，繳納額度是按照收入水平不同而繳納。留學生一般視為無收入群體，繳納最低額度的保險費(約2000日元左右)，看病時只需個人負擔30%的醫(yī)藥費用。
4、住宿費日本國立大學一般設有國際交流會館，租金低廉，多在5900～10000日元之間，因申請者多，不能保證赴日后立即入住;但可申請民間留學生宿舍，租金多在2～5萬日元之間。此為一般情況，隨匯率、宿舍種類有所不同。
5、交通費(1)東京地鐵：成人單程票價種類有：160日元(起步價1-6公里內(nèi))、190日元、230日元、270日元和300日元;兒童單程票價種類有：80日元、100日元、120日元、140日元、150日元按乘坐距離購買。
（2）火車(東京內(nèi)的JR火車的山手線yamanoteline)：130-210日元(3)新干線火車(bullettrains)：東京到大阪(tokyo-osaka)：13750日元(單程普通車廂);東京到仙臺(tokyo-sendai)：10590日元(單程普通車廂);東京到廣島(tokyo-hiroshima)：18050日元(單程普通車廂)(4)巴士：成人200日元的士：起步價(2公里內(nèi))650日元。留學期內(nèi)，建議最好買月票。
