鱘科最早可以追溯至7000萬(wàn)年前的白堊紀(jì)，而淺色鱘魚一直沒(méi)有主要改變，可以說(shuō)是一種由恐龍時(shí)代留下來(lái)的遺跡。

早期的DNA研究認(rèn)為淺色鱘魚及密西西比鏟鱘是同一物種。但是于2000年的研究，在比較所有三種鏟鱘屬的DNA序列后，才發(fā)覺(jué)它們分別為三個(gè)獨(dú)立的物種。2001年及2006年間的幾項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)在北部的淺色鱘魚是生殖隔離的，且與路易西安納州阿查費(fèi)耶拉河（Atchafalaya River）的南部群落在基因上有所不同。不過(guò)這種不同并非是物種層級(jí)的。淺色鱘魚的南部群落在密蘇里河盆地中部與密西西比鏟鱘的混種較多，而北部群落則較少。在阿查費(fèi)耶拉河有最多的混種?；旆N的基因與淺色鱘魚的不同，但與密西西比鏟鱘的無(wú)法區(qū)分?；旆N是否能夠生殖仍未知。