到2013年，該校擁有9個學部和5個大學院研究科，以及腦研究所、災害・復興科學研究所、醫(yī)齒學綜合醫(yī)院等研究機構。學生數(shù)約為13,000人、教職人員約為2,900人。是日本國本州島、日本海沿岸一側規(guī)模最大的名牌綜合性國立大學。包括位于市區(qū)西部的面積最大的五十嵐校區(qū)，位于市中心的醫(yī)學系學部・機構集中的旭町校區(qū)以及位于西大畑地區(qū)的設立教育人類科學部附屬學校以及面向社會人學生授課的新潟站南校區(qū)等三處校區(qū)。另外，也在長岡市擁有附屬學校（小學校、中學校、幼兒園），在佐渡市擁有理學部附屬臨海實驗所，在同市和中蒲原郡村松町擁有農學部附屬稻田科學教育研究中心。日本國國立大學“大學院重點化”項目的重點大學之一。*日本的大學院即中國所說的研究生院日本國國立大學“大學院重點化”項目選中大學一覽（合計16校）東京大學京都大學 北海道大學 東北大學 大阪大學 名古屋大學九州大學（舊帝國大學）新潟大學 岡山大學 金澤大學 廣島大學 一橋大學 神戶大學 筑波大學東京工業(yè)大學（舊官立大學）東京醫(yī)科齒科大學2013年3月，日本戰(zhàn)前就存在的六所名門舊官立大學（新潟大學金沢大學千葉大學岡山大學熊本大學長崎大學）簽署國立六大學聯(lián)合協(xié)議，從而強化資源共享，培養(yǎng)國際化研究性人才，增強國際競爭力。