學校設有15個院（系），包括人文與社會科學學院、教育學院、醫(yī)護學院、公共衛(wèi)生學院、科學學院、工程學院、藝術學院、文學院、海洋技術學院、研究生院、寶石學院、海事學院、商學院、公共管理學院和運動科學學院。

東方大學設有50個本科專業(yè)、30個碩士專業(yè)、3個博士專業(yè)。另外，每年還提供一些短期培訓課程計劃。