基因組組蛋白甲基化和組蛋白基因組甲基化有什么區(qū)別曾經(jīng)是2009年最值得關(guān)注的技術(shù)。

遺傳上除了ATGC這四種堿基，人們對(duì)第五種堿基-甲基化的胞嘧啶的興趣也日益增加。甲基化修飾的存在對(duì)DNA轉(zhuǎn)錄的調(diào)控起了重要作用，異常的甲基化往往是許多疾病的起因。既然如此重要，系統(tǒng)繪制甲基化組的方法自然也多了起來(lái)。甲基化組（methylome）這個(gè)詞還不太常見，它指的是全基因組范圍內(nèi)的甲基胞嘧啶。美國(guó)Salk生物研究院的JosephEcker及其同事剛剛通過高通量測(cè)序的方法，展現(xiàn)了一張人胚胎干細(xì)胞中所有甲基胞嘧啶的完整圖譜。這是第一張單堿基分辨率的哺乳動(dòng)物甲基化圖譜，并伴隨著mRNA和小RNA以及一些組蛋白修飾的比較分析。他們發(fā)現(xiàn)胚胎干細(xì)胞中近四分之一的甲基化是在非CG背景下，暗示胚胎干細(xì)胞采用不同的甲基化機(jī)制來(lái)影響基因調(diào)控。隨著ES細(xì)胞的誘導(dǎo)分化，非CG甲基化消失，而在iPSC中還原。這張圖譜為未來(lái)人類疾病和發(fā)育中的表觀遺傳學(xué)修飾研究打下了基礎(chǔ)。美國(guó)Whitehead研究院的Meissner等也曾繪制了類似的圖譜。他們利用高通量的亞硫酸氫鹽測(cè)序和單分子測(cè)序，產(chǎn)生了覆蓋大部分CpG島的DNA甲基化圖譜。他們發(fā)現(xiàn)，DNA甲基化模式與組蛋白甲基化模式的相關(guān)性比基因組序列更好；CpG的甲基化是動(dòng)態(tài)的表觀遺傳標(biāo)志，在細(xì)胞分化期間經(jīng)歷大量的改變。他們還發(fā)現(xiàn)，胚胎干細(xì)胞和原代細(xì)胞中與發(fā)育調(diào)控相關(guān)的“弱”CpG島在體外增殖期間經(jīng)歷了異常的超甲基化，讓人想起某些原發(fā)腫瘤。另外，兩個(gè)獨(dú)立的研究小組，分別為哈佛大學(xué)的GeorgeChurch等，以及加州大學(xué)的KunZhang連同弗吉尼亞聯(lián)邦大學(xué)的YuanGao等，也將傳統(tǒng)的甲基化工具如DNA的重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化與目標(biāo)基因組捕獲技術(shù)和高通量測(cè)序相結(jié)合，定量測(cè)定人基因組中的甲基化。