哥本哈根大學(xué)位于北歐和歐洲大陸的十字路口，擁有500多年的歷史。建校以來，從中世紀(jì)的學(xué)術(shù)先師同教廷、國王的抗辯，到20世紀(jì)上半葉兩位科學(xué)巨匠玻爾與愛因斯坦之間的學(xué)術(shù)爭(zhēng)論，構(gòu)成一部不斷探索真理、追求極致、繁榮文化、開拓文明的教育創(chuàng)業(yè)史。哥本哈根大學(xué)成立于1479年6月1日，國王克里斯蒂安一世批準(zhǔn)其成立。和歐洲其他國家早期的大學(xué)一樣，哥本哈根大學(xué)最初也是由天主教會(huì)創(chuàng)建，屬天主教會(huì)管轄，以培養(yǎng)教士、傳播基督教思想為職責(zé)。早期的哥本哈根大學(xué)的專業(yè)設(shè)置除神學(xué)外，還包括法學(xué)、醫(yī)學(xué)和哲學(xué)。1482年，大學(xué)圖書館建立。1533年至1536年，學(xué)校經(jīng)歷了3年丹麥內(nèi)戰(zhàn) 。1537年馬丁·路德新教改革之后，哥本哈根大學(xué)轉(zhuǎn)歸丹麥路德會(huì)(Danish Lutheran State Church) 并得以重建，從天主教大學(xué)轉(zhuǎn)變?yōu)樾陆檀髮W(xué)，新?；丈系娜宋锞褪桥鷾?zhǔn)并支持這次重建的國王克里斯蒂安三世。1569年，弗雷德里克二世為學(xué)校的師生設(shè)立了獎(jiǎng)學(xué)金基金。1642年，學(xué)校啟用在圓塔(Rundetårn) 的天文臺(tái)。1654年，大學(xué)圖書館遷址至圓塔附近。1661年，弗雷德里克三世開始籌建皇家圖書館。1675年至1788年間，哥本哈根大學(xué)引進(jìn)了學(xué)位考試制度，這種制度最先應(yīng)用于神學(xué)院，之后向其他學(xué)院推廣。課程越來越多，尤其在醫(yī)科和法學(xué)方面，發(fā)展非常迅速，學(xué)院漸具規(guī)模。哥本哈根大學(xué)的圖書館、教學(xué)醫(yī)院等重要項(xiàng)目也陸續(xù)興建起來，成為丹麥高等教育及科研中心。1788年的憲章劃定了大學(xué)的職權(quán)范圍，促使學(xué)校從古典歐洲大學(xué)轉(zhuǎn)型成為現(xiàn)代化的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)，所有專業(yè)的學(xué)生必須參加學(xué)位考試來獲取學(xué)位證書，學(xué)校也開始把重心從教學(xué)轉(zhuǎn)移到研究上。1842年和1850年之間，哥本哈根大學(xué)進(jìn)行了大規(guī)模的院系調(diào)整。原來的醫(yī)學(xué)院和外科醫(yī)學(xué)研究所合并為保健科學(xué)學(xué)院。1848年，法學(xué)院內(nèi)也進(jìn)行了調(diào)整，將新興的政治學(xué)科歸入法學(xué)院。1850年，數(shù)學(xué)和自然科學(xué)專業(yè)從哲學(xué)院中分離出來，單獨(dú)成為一個(gè)獨(dú)立的學(xué)院。1877年，哥本哈根大學(xué)錄取了第一位女學(xué)生。20世紀(jì)上半葉，發(fā)軔于第五屆索爾維會(huì)議的的哥本哈根學(xué)派與愛因斯坦、普朗克、薛定諤、馬克斯·馮·勞厄、德布羅意等人之間的學(xué)術(shù)爭(zhēng)論 被視為物理史上最偉大的對(duì)決。彌漫在這里濃郁而清新的學(xué)術(shù)自由空氣，使這所古老學(xué)府歷久常新。1960年至1980年間是哥本哈根大學(xué)發(fā)展的黃金時(shí)期。期間，學(xué)生人數(shù)從6，000增至26，000，教職員工人數(shù)也相應(yīng)大規(guī)模地增加。此外，這一時(shí)期內(nèi)還興建了新的動(dòng)物學(xué)博物館，以及以奧斯特和奧古斯特·克羅命名的研究所。哥本哈根大學(xué)于1970年頒布校規(guī)，規(guī)定對(duì)大學(xué)施行民主化管理。1973年，這一規(guī)定得到修正，并很快被丹麥的所有高等教育機(jī)構(gòu)所采納。1990年至1993年期間的改革使得大學(xué)開設(shè)的所有專業(yè)都有授予學(xué)士學(xué)位的資格。1993年，法學(xué)專業(yè)脫離社會(huì)科學(xué)學(xué)院而成為獨(dú)立的法學(xué)院。1994年，哥本哈根大學(xué)開設(shè)環(huán)境科學(xué)、南北關(guān)系和生物工藝學(xué)等新專業(yè)，并在政策上給予傾斜，以適應(yīng)其長(zhǎng)期發(fā)展的需要。從1996年開始，哥本哈根大學(xué)又陸續(xù)建造了一些新的建筑，包括阿邁厄島 (Amager) 上的生物技術(shù)中心和人文學(xué)院大樓（今South Campus）。1997年，哥本哈根大學(xué)與西蘭島上的其他丹麥高校，以及厄勒海峽彼端的瑞典高等教育機(jī)構(gòu)加強(qiáng)聯(lián)系，形成了信息互通、資源共享的學(xué)術(shù)共同體 (Øresund University)，哥本哈根大學(xué)和隆德大學(xué)設(shè)立了秘書處。隨著厄勒海峽大橋的開通，兩岸交流更是日益頻繁，一躍成為北歐最具科研創(chuàng)新活力的地區(qū) (Øresund Science Region)。21世紀(jì)初，學(xué)校有超過3萬7千多名學(xué)生和7千多名職工，成為全國最大的教學(xué)機(jī)構(gòu)。2006年，學(xué)校宣布開始逐漸撤離擁有超過五百年歷史的哥本哈根內(nèi)城古教學(xué)建筑，對(duì)日益增多的院系部門進(jìn)行集中化，以便形成更大、更現(xiàn)代化的校區(qū)和加強(qiáng)跨學(xué)科合作。2007年，因合并皇家獸醫(yī)和農(nóng)業(yè)大學(xué)和丹麥的皇家藥大學(xué)，哥本哈根大學(xué)納入了兩個(gè)新學(xué)院：生命科學(xué)學(xué)院和醫(yī)藥科學(xué)學(xué)院。生命科學(xué)學(xué)院和醫(yī)藥科學(xué)學(xué)院的生命科學(xué)、藥學(xué)科學(xué)聯(lián)同衛(wèi)生科學(xué)，使其成為北歐最大的健康和生命科學(xué)中心之一。2012年，醫(yī)藥科學(xué)學(xué)院、衛(wèi)生科學(xué)學(xué)院、三分之一的生命科學(xué)學(xué)院合并為醫(yī)藥與健康科學(xué)學(xué)院，剩下三分之二的生命科學(xué)學(xué)院并入自然科學(xué)學(xué)院。至此，六大院系形成 。2013年4月，皇家圖書情報(bào)學(xué)院 (The Royal School of Library and Information Science) 正式并入人文學(xué)院。