留駐南京：1 文學院,理學院--南京大學2 工學院部分院系--南京工學院--東南大學3 工學院水利系--河海大學4 工學院化工系--南京化工學院--南京化工大學--南京工業(yè)大學5 師范學院--南京師范大學6 農(nóng)學院--南京農(nóng)業(yè)大學7 農(nóng)學院林學系--南京林業(yè)大學8 南京大學氣象工程系--南京氣象學院--南京信息工程大學外遷：9 商學院--上海財經(jīng)大學10 工學院航空系--華東航空學院--西北工業(yè)大學 （西安）11 醫(yī)學院--第五軍醫(yī)大學--第四軍醫(yī)大學12 工學院食品工程系--無錫輕工業(yè)學院--無錫輕工業(yè)大學--江南大學 （無錫）13 工學院農(nóng)業(yè)機械系--江蘇工學院--江蘇理工大學--江蘇大學 （鎮(zhèn)江）14 法學院--華東政法學院 --華東政法大學（上海）15 中科院心理研究所 16 金陵大學影音部---中央電影學校---北京電影學院17 中央大學醫(yī)學院－－上海醫(yī)學院－－上海醫(yī)科大學－－復旦大學醫(yī)學院18 工學院電子工程系有線電部分－－成都電訊工程學院－－電子科技大學（成都）19 國立中央大學音樂學院－－中央音樂學院