1856年3月6日，私立馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院成立。

1858年，巴爾的摩男爵的后裔Charles Benedict Calvert用兩萬一千美元在克里奇帕克市區(qū)購買了一個面積為420英畝的種植園，并將其贈送給馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院。同年Charles Benedict Calvert又把一些其股票所得的資金提供給馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院。1859年10月6日，第一批包括Charles Benedict Calvert的四個兒子在內(nèi)的34名學(xué)生開始在馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院學(xué)習(xí)。1862年7月，馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院授予了第一批學(xué)位。同月，林肯簽署了Morrill Land撥款法案。這項法案為眾多大學(xué)提供聯(lián)邦政府資助，來提升各州的農(nóng)業(yè)、工程和軍事教育。1864年，馬里蘭州立法院通過了Morrill Land撥款法案，同意私立馬里蘭農(nóng)業(yè)接受資助。 美國內(nèi)戰(zhàn)結(jié)束后馬里蘭州立法院結(jié)束了馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院的破產(chǎn)狀態(tài)并獲取了其一半的所有權(quán)。馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院成為一所半公立學(xué)院。內(nèi)戰(zhàn)期間南方將軍羅伯特·李(Robert E. Lee)的兒子George Washington Curtis Lee被任命為戰(zhàn)后第一任校長。但是由于公眾的不滿，George Washington Curtis Lee拒絕的這個職位。1867年10月馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院重新成立并招收了11名學(xué)生。在隨后的6年里，馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院償還了所有的債務(wù)。在此后的二十年內(nèi)，由于聯(lián)邦政府投資的一個農(nóng)業(yè)試驗站的成立，馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院開始成為一個研究機(jī)構(gòu)。同期馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院還在一系列領(lǐng)域獲得了管理權(quán)，例如農(nóng)場疾病控制，牧草檢查；還建立了州氣象局以及林業(yè)會議。1888年馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院開始了正是的校際籃球比賽，當(dāng)年的對手有St. John's College和美國海軍學(xué)院。1897年，第一個兄弟會Phi Sigma Kappa進(jìn)入了馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院。1898年Morrill Hall建立，這是馬里蘭大學(xué)仍然在使用的教學(xué)樓中歷史最悠久的建筑。 1912年11月29日晚10點30分，正在舉行感恩節(jié)舞會的新行政樓閣樓發(fā)生火災(zāi)。起火原因可能是電線短路。在場的大約80名學(xué)生全部安全逃生并排隊傳遞水桶救火。但是由于當(dāng)時的大風(fēng)，學(xué)生宿舍，以及除Morrill Hall之外的所有學(xué)術(shù)建筑都被引燃。盡管沒有人傷亡，學(xué)校損失約25萬美元，折合2005年匯率約5百萬美元。校長Richard Silvester辭職。當(dāng)時很多人以為馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院會關(guān)閉。但是學(xué)生沒有放棄。在寒假結(jié)束后除兩人外其他全部學(xué)生回到了學(xué)校并堅持學(xué)校應(yīng)繼續(xù)正常教學(xué)。在學(xué)生宿舍建好之前，學(xué)生被安置在附近的居民家中，租金后來由學(xué)校支付。但是行政樓一直到1940年才重建。在1912年學(xué)校的中心所在的位置建立了一個混凝土指南針，指南針上指出了當(dāng)年被火燒毀的每一座建筑的方向。1916年馬里蘭州獲取了馬里蘭農(nóng)業(yè)學(xué)院的全部所有權(quán)并把學(xué)校更名為馬里蘭州立學(xué)院（Maryland State College）。同年第一個女生入學(xué)，四年后姐妹會進(jìn)入學(xué)校。1920年4月9日，馬里蘭州立學(xué)院同巴爾的摩的一些職業(yè)學(xué)校合并成為馬里蘭大學(xué)（University of Maryland）。同年馬里蘭大學(xué)研究生院授予了第一個哲學(xué)博士學(xué)位，學(xué)校學(xué)生總數(shù)超過了500人。1951年第一個非洲裔學(xué)生入學(xué)，當(dāng)時學(xué)生總數(shù)已經(jīng)接近10000人，其中約4000名女生。1957年校長Wilson H. Elkins發(fā)起了一個提高學(xué)校教學(xué)水平的運動。最終學(xué)校建立了一個學(xué)術(shù)考察計劃。在學(xué)術(shù)考察計劃實行的第一年，占當(dāng)時學(xué)生總數(shù)18%的1550名學(xué)生面臨開除。隨后學(xué)校的教學(xué)水平顯著提高。1988年，馬里蘭大學(xué)系統(tǒng)成立，大學(xué)園校區(qū)被正式命名為馬里蘭大學(xué)學(xué)院市分校。1997年，馬里蘭人民大會（the Maryland General Assembly）通過立法決定將“馬里蘭大學(xué)學(xué)院市分?！狈Q為“馬里蘭大學(xué)”。需要指出的是其他名稱中帶有“馬里蘭大學(xué)”的學(xué)校并非馬里蘭大學(xué)學(xué)院市分校的分校。2001年9月24日，九一一襲擊事件后13天，一場龍卷風(fēng)橫掃馬里蘭大學(xué)學(xué)院市分校，導(dǎo)致兩名學(xué)生死亡，12棟建筑損壞。學(xué)校損失達(dá)到1500萬美元。