1472年，巴伐利亞-蘭茨胡特公爵路德維希九世在因戈爾施塔特創(chuàng)建巴伐利亞第一所大學(xué)。

1800年，馬克西米利安一世將大學(xué)移至蘭茨胡特，并于1802年起更名為“路德維希-馬克西米利安大學(xué)”。1826年，路德維希一世國王將大學(xué)帶到慕尼黑。2006年10月成為德國為提升大學(xué)研究質(zhì)量的“德國大學(xué)卓越計劃”之“精英大學(xué)”之一。2012年6月15日揭曉的第二輪卓越計劃評選中，持續(xù)保有精英大學(xué)的稱號，并獲得未來五年的研究資助。