工程碩士和專業(yè)碩士的區(qū)別主要有：

1、人才培養(yǎng)方向不同：專業(yè)型碩士培養(yǎng)應(yīng)用型和工程研究型人才，工程碩士是培養(yǎng)學(xué)術(shù)研究型人才。

2、就業(yè)發(fā)展方向不同：工程碩士主要是去研究所搞研發(fā)工作，專業(yè)碩士主要是進入企業(yè)發(fā)展，就業(yè)更靈活，發(fā)展空間更大。

3、學(xué)制不同：專業(yè)型碩士一般2至3年，其中不少于半年的實習(xí)期，工程碩士基本上以學(xué)習(xí)理論為主，學(xué)制一般為3至5年。材料補充：工程碩士屬于專業(yè)碩士的一種，是工程類專業(yè)，分為全日制工程碩士和非全日制工程碩士。工程碩士專業(yè)學(xué)位是指工程領(lǐng)域任職資格相聯(lián)系的專業(yè)性學(xué)位，與學(xué)術(shù)碩士的工學(xué)碩士處于同一層次，但類型不同，各有側(cè)重。工程碩士專業(yè)在招收對象、培養(yǎng)方式和知識結(jié)構(gòu)與能力等方面，與工學(xué)碩士有不同的特點。工程碩士招收對象主要為獲得學(xué)士學(xué)位后具有三年以上工程實踐經(jīng)驗的優(yōu)秀在職人員。獲得學(xué)士學(xué)位的應(yīng)屆大學(xué)本科畢業(yè)生考取攻讀工程碩士專業(yè)學(xué)位，亦可進行工程碩士專業(yè)學(xué)位論文（設(shè)計）答辯。