哥本哈根大學(xué)六大學(xué)院為：健康與醫(yī)藥科學(xué)學(xué)院、人文學(xué)院、法學(xué)院、理學(xué)院、社科學(xué)院、神學(xué)院。

哥本哈根大學(xué)起初有五大學(xué)院，它們分別是：神學(xué)院、社科學(xué)院、健康學(xué)院、人文學(xué)院和理學(xué)院，以及一個(gè)校外的口腔中心。所有本科課程以丹麥語(yǔ)授課為核心，且學(xué)生入學(xué)后每學(xué)期都有充分的英語(yǔ)課程，能獲取學(xué)分。哥本哈根大學(xué)設(shè)有超過(guò)100個(gè)科系或中心以進(jìn)行教學(xué)與研究工作，各個(gè)科系劃分成不同專(zhuān)業(yè)，不少專(zhuān)業(yè)在研究生階段又細(xì)分為不同的專(zhuān)攻 (Specialization) 。經(jīng)過(guò)不斷的調(diào)整與2012年的院系歸并，才發(fā)展為現(xiàn)今的六大學(xué)院。