1、事業(yè)單位使用事業(yè)編制，按編制類型來分，可以分為全額事業(yè)單位、差額事業(yè)單位、自收自支事業(yè)單位。

其中全額是指人員經(jīng)費、工資福利等由財政全額供養(yǎng)的單位，差額單位和自收自支單位都具備一部分或者全部的生產(chǎn)經(jīng)營職能，可以部分或者全部自給。在事業(yè)單位改革中，自收自支事業(yè)單位要進行轉(zhuǎn)型，將承擔(dān)的公益服務(wù)職能，整合到其他事業(yè)單位，將承擔(dān)的生產(chǎn)經(jīng)營、收費、中介等職能，推向社會，參與市場自由競爭。《機構(gòu)編制法》頒布之后，除法律規(guī)定的編制類型外，不允許使用自收自支、自定、自籌類編制。

2、按事業(yè)單位分類改革中規(guī)定的分類，事業(yè)單位可以分為行政類事業(yè)單位、公益類事業(yè)單位、生產(chǎn)經(jīng)營類事業(yè)單位。行政類事業(yè)單位，是指完全、主要或者部分承擔(dān)行政職能的事業(yè)單位，目前省市縣三級此類事業(yè)單位正在改革，要求將其承擔(dān)的行政職能，全部劃歸行政機關(guān)行使，承擔(dān)的公益服務(wù)職能保留，按其職能性質(zhì)進行整合。公益類事業(yè)單位，又分為公益一類和公益二類。公益二類事業(yè)單位改革要求，將其承擔(dān)的生產(chǎn)經(jīng)營、中介、收費等職能剝離，改制為企業(yè)運營，將其承擔(dān)的公益服務(wù)職能進行整合。今后，事業(yè)單位實行政事分開、政企分開、管辦分離，只承擔(dān)公益服務(wù)職能。生產(chǎn)經(jīng)營類事業(yè)單位，是指其生產(chǎn)的產(chǎn)品或提供的服務(wù)，可以由市場代替。這類事業(yè)單位全面改企，機構(gòu)撤銷，使用的事業(yè)單位收回統(tǒng)籌使用，自收自支和自定自籌類編制撤銷。正式職工和退役軍人分流到其他事業(yè)單位任職，人事代理、合同工、勞務(wù)派遣工等合同制管理人員自主擇業(yè)。

3、按管理權(quán)限劃分，事業(yè)單位又可以分為黨委直屬事業(yè)單位、政府直屬事業(yè)單位、行政部門下屬的事業(yè)單位，以及行政部門的內(nèi)設(shè)機構(gòu)、事業(yè)單位的下屬事業(yè)單位等。

4、按級別不同，又可以分為省直、市直、縣直事業(yè)單位，鄉(xiāng)鎮(zhèn)的七站八所等。

5、按財政狀況，還可以分為財政獨立的事業(yè)單位，財政未獨立的事業(yè)單位。

6、按是否具備獨立的法人資格，又可以分為法人事業(yè)單位，非法人事業(yè)單位。

7、事業(yè)單位受機構(gòu)個數(shù)和職能限制，各地成立的事業(yè)單位中，省、市級別的基本相似，縣區(qū)比較復(fù)雜，有的多有的少，有的單獨成立，有的職能整合成立綜合中心，并不要求一一對應(yīng)。