盡管公派留學相對于自費留學會省去了留學費用，但其的弊端其實也是相當明顯的。

首先，公派留學選手給予了一個良好背景的人士，不少學生可能并沒有實力去申請公派留學。其次，由于公派留學被認為是“國家的臉面”，因此往往會有政治信息的干預影響，導致學生可能無法自由選擇科目和學校。再者，大多數(shù)公費留學中，該生需要回國履行約定，如在某些高?；蜓芯繖C構工作一定時間等，這勢必會影響到該生的未來選擇。