南京大學城主要分為三個大學城。

1、仙林大學城。現(xiàn)已有南京大學、南京師范大學（含中北學院）、南京財經(jīng)大學、南京郵電大學、南京中醫(yī)藥大學、南京森林公安高等專科學校、南京理工大學紫金學院等11所高校；

2、江寧大學城。包括南京航空航天大學，東南大學，正德學院，南京醫(yī)科大學，江蘇經(jīng)貿(mào)學院，江蘇海事學院，南京交通學院，南京金陵科技學院，南京曉莊學院，中國傳媒大南京分校（南廣學院），南京工程學院；

3、江浦（浦口）大學城。包括南京工業(yè)大學，南京審計學院，東南大學，南京大學，南京信息工程大學，南京農(nóng)業(yè)大學工學院。