目前，西南大學共有兩個校區(qū)，分別為北碚校區(qū)和榮昌校區(qū)，其中北碚校區(qū)為主校區(qū)。

1、地理位置不同

北碚校區(qū)：北碚區(qū)

榮昌校區(qū)：榮昌區(qū)

2、開設專業(yè)不同

北碚校區(qū)：絕大部分專業(yè)，包括師范專業(yè)、計算機專業(yè)等。

榮昌校區(qū)：少數(shù)專業(yè)，包括信息管理與信息系統(tǒng)、市場營銷、物流管理、動物科學、水產(chǎn)養(yǎng)殖學、動物醫(yī)學等。

3、報考人氣不同

北碚校區(qū)：高，錄取分數(shù)線也高。

榮昌校區(qū)：低，錄取分數(shù)線也低很多。

4、外界口碑不同

北碚校區(qū)：好，重慶市少有的211大學名校之一，辦學底蘊深厚，校園漂亮，外界評價高。

榮昌校區(qū)：差，被很多人認為是二本大學，校園占地小，與北碚校區(qū)沒法比。

西南大學目前是北碚校區(qū)和榮昌校區(qū)兩個校區(qū)。兩個個校區(qū)的區(qū)別是主校區(qū)與榮昌校區(qū)。北碚校區(qū)是西南大學主校區(qū)，這是全重慶乃至全國最大的校園，面積近一萬畝。由原西南師范大學和西南農(nóng)業(yè)大學組成。原西南農(nóng)業(yè)大學在2001年與四川畜牧獸醫(yī)學院，中國農(nóng)業(yè)科學院柑桔研究所合併，2005年西南農(nóng)業(yè)大學與西南師范大學合并后，位于榮昌的原四川畜牧獸醫(yī)學院就成了西南大學一個校區(qū)。