在動漫《名偵探柯南》中，工藤新一最先在第1集《再見了，工藤新一》中出現(xiàn)，并在隨后的幾十集中持續(xù)出現(xiàn)。

下面是工藤新一相關(guān)劇情和對應(yīng)集數(shù)：第1集《再見了，工藤新一》：講述了工藤新一被組織下毒變成小學(xué)生柯南的故事第54-56集《工藤新一紐約事件》：講述了工藤新一前往紐約解決謎案的故事。第129-130集《工藤新一的犯罪預(yù)感》：講述了工藤新一回到中學(xué)繼續(xù)追查黑衣組織的故事。第176-178集《工藤新一失蹤事件》：講述了工藤新一與黑衣組織的對決以及他失蹤的故事。第345-347集《工藤新一京都挽歌》：講述了工藤新一和小蘭前往京都旅行時卷入的神秘謀殺案。