截至2020年1月內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)呼市分別在，蒙古醫(yī)科大學(xué)金山校區(qū)(呼和浩特市金山經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū))；新華校區(qū)(回民區(qū)呼和浩特市新華大街5號(hào)) ;錫林校區(qū)（賽罕區(qū)呼和浩特市錫林郭勒南路60號(hào))三個(gè)教學(xué)園區(qū)， 學(xué)校成立于1956年，原名內(nèi)蒙古醫(yī)學(xué)院，是新中國在少數(shù)民族地區(qū)最早建立的高等醫(yī)學(xué)院校之一，當(dāng)時(shí)隸屬于國家衛(wèi)生部，1958年劃歸內(nèi)蒙古自治區(qū)管理。

2012年3月，經(jīng)教育部批準(zhǔn)，更名為內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)。 總占地面積1848畝，總建筑面積796畝，教學(xué)科研儀器設(shè)備總值38531.93萬元，各類圖書文獻(xiàn)196.08萬冊(cè)（種）；設(shè)有15個(gè)教學(xué)單位，有3所直屬附屬醫(yī)院、4所非直屬附屬醫(yī)院，10所臨床醫(yī)學(xué)院，開設(shè)32個(gè)本科專業(yè)；有專任教師949人，現(xiàn)有全日制在校生15450人。其中，本科生11185人、?？粕?165人、研究生1922人、留學(xué)生108人，民族預(yù)科生70人。