安徽醫(yī)科大學(xué)的前身是1926年5月由郭琦元、湯蠡舟等在原亞東醫(yī)大的校址上（上海市滬軍營(yíng)）創(chuàng)辦的私立東南醫(yī)科大學(xué)。

當(dāng)年9月10日開學(xué)。

1949年響應(yīng)中共中央華東局“面向農(nóng)村，走向內(nèi)地”的號(hào)召，內(nèi)遷安徽懷遠(yuǎn)。

1952年定址合肥，改名安徽醫(yī)學(xué)院。

1985年更名安徽醫(yī)科大學(xué)。作為安徽醫(yī)藥高等教育的發(fā)源地，學(xué)校始終是安徽省高等醫(yī)學(xué)教育事業(yè)和衛(wèi)生健康事業(yè)的開創(chuàng)者、孕育者和引領(lǐng)者。