安徽醫(yī)科大學的前身是1926年5月由郭琦元、湯蠡舟等在原亞東醫(yī)大的校址上（上海市滬軍營）創(chuàng)辦的私立東南醫(yī)科大學。

當年9月10日開學。

1949年響應中共中央華東局“面向農村，走向內地”的號召，內遷安徽懷遠。

1952年定址合肥，改名安徽醫(yī)學院。

1985年更名安徽醫(yī)科大學。作為安徽醫(yī)藥高等教育的發(fā)源地，學校始終是安徽省高等醫(yī)學教育事業(yè)和衛(wèi)生健康事業(yè)的開創(chuàng)者、孕育者和引領者。