武漢大學最初是沒有櫻花的，后來的櫻花是抗日戰(zhàn)爭時期，侵華日軍占領武漢，把武漢大學收為軍用，一部分校舍成為了日軍醫(yī)院，日軍為了緩解住在這里休養(yǎng)的大批日兵傷員的思鄉(xiāng)之情，同時亦有炫耀武功和長期占領之意，從國內運來了櫻花，開始在武大校園栽種，這是武大的第一批櫻花 也是日本侵華的罪證，同時也是武大櫻花的緣起。

第一批櫻花栽種不超過30株，隨著抗日戰(zhàn)爭結束，日本投降后，這批櫻花陸續(xù)死掉了。

1972年中日邦交正?；毡臼紫噘浰臀覈?000株大山櫻，有關部門將其中50株轉贈給了武漢大學。后來陸續(xù)有一些中日友好團體向武大贈送了300余株櫻花苗。隨后武大園林科更是引進和栽種櫻花樹苗600余株，并且武大引進和栽種櫻花的行動從未停止。