克市是西伯利亞的教育中心之一，規(guī)模僅次于新西伯利亞。

有超過30家高等院校 (多數(shù)是俄羅斯科學(xué)院的分支機(jī)構(gòu))和約200家中學(xué)。最重要的院校有：西伯利亞聯(lián)邦大學(xué) (俄語簡寫 КГУ)，成立于1963年，原為新西伯利亞國立大學(xué)的分校，1969年獨(dú)立，后更名為克拉斯諾亞爾斯克國立大學(xué)。克拉斯諾亞爾斯克國立科技大學(xué) (俄語簡寫 КГТУ)，成立于1956年。克拉斯諾亞爾斯克國立師范大學(xué) (俄語簡寫 КГПУ)，成立于1932年。西伯利亞國立科技大學(xué) (俄語簡寫 СйбДТУ)1930年成立，初稱西伯利亞林學(xué)院，為全市最古老的院校Sukachev林學(xué)院，成立于1944年。此外還有克拉斯諾亞爾斯克大學(xué)、克拉斯諾亞爾斯克農(nóng)業(yè)大學(xué)以及克拉斯諾亞爾斯克藝術(shù)學(xué)院、有色金屬和黃金學(xué)院、商學(xué)院、建筑工程學(xué)院、醫(yī)學(xué)院、師范學(xué)院、工學(xué)院、西伯利亞美術(shù)學(xué)院、西伯利亞航空學(xué)院、西伯利亞水運(yùn)工程學(xué)院等。 與新西伯利亞一樣，克市也設(shè)立了科學(xué)城。當(dāng)中的生物物理研究所曾經(jīng)在1973至85年間成功進(jìn)行類似美國生物圈二號(hào)的實(shí)驗(yàn) (稱為Bios)。