一、研究對象不同1,從研究的對象來看，自然科學(xué)是研究無機自然界和包括人的生物屬性在內(nèi)的有機自然界的各門科學(xué)的總稱。
現(xiàn)代自然科學(xué)產(chǎn)生于四百年前，在發(fā)展的過程中，不斷有新的假說、新的學(xué)科產(chǎn)生，并不斷更新、淘汰原有的理論。但其基本假設(shè)一直未變，就是認為物質(zhì)世界是客觀的、無意識的，自然規(guī)律不受人的主觀意志影響。
2,人文科學(xué)，則是那些研究人類的交流、信仰、情感、道德和美感等的各門科學(xué)的總稱，其拉丁文的本意為人性與教養(yǎng)。人文科學(xué)是以人的社會存在為研究對象，以揭示人類社會的本質(zhì)和發(fā)展規(guī)律為目的的科學(xué)。人文科學(xué)研究不僅僅是一種真理性探索，往往還代表了一定的價值觀和社會集團的利益。人文科學(xué)呈現(xiàn)過程區(qū)別于自然科學(xué)與社會科學(xué)對普遍規(guī)律的發(fā)掘和思考，人文科學(xué)更多關(guān)注的是人性主觀意識中“具體的”、“個別的”和“獨特的”價值觀，突出獨特性、意外性、復(fù)雜性和創(chuàng)造性。二學(xué)科細節(jié)分枝不同1,從涉及學(xué)科的細節(jié)來看，自然科學(xué)涉及有機自然科學(xué)和無機自然科學(xué)兩類。一切生命科學(xué)，其中包括人的生理學(xué)和人類學(xué)以及高級神經(jīng)活動生理學(xué)和心理學(xué)的一部分屬于第一類；宏觀和微觀力學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)、地質(zhì)學(xué)和天文學(xué)等屬于第二類。隨著人類對客觀世界的認知不斷加深不斷拓寬，人類改造自然的實踐活動不斷發(fā)展，自然界(包括人工創(chuàng)造的物質(zhì))極其廣泛的內(nèi)在聯(lián)系和規(guī)律不斷被揭示，不但高度發(fā)展了原有基礎(chǔ)學(xué)科，還出現(xiàn)了像控制論、信息論、系統(tǒng)論這樣的新的橫斷學(xué)科，更發(fā)展出了一系列應(yīng)用性學(xué)科。
2,人文科學(xué)包括語言學(xué)、文學(xué)、哲學(xué)、考古學(xué)、藝術(shù)史、藝術(shù)理論以及具有人文主義內(nèi)容和運用人文主義方法的其他社會科學(xué)等，與自然科學(xué)在探究和解釋世界的方式上存在根本的區(qū)別，不同的思維角度，不同的概念定位，不同的語言表達形式，等等。
三、學(xué)科屬性不同如果說自然科學(xué)是理性的產(chǎn)物，那人文科學(xué)一定是感性的想象的產(chǎn)物，它使用現(xiàn)象與實在、命運與自由意志等概念，并用情感性的和目的性的語言來表達。
