35°42'39.21"N,139°45'43.99"E東京大學(xué)校區(qū)設(shè)在東京都內(nèi)文京區(qū)本鄉(xiāng)，占地面積 40 公頃，全校絕大部分機(jī)構(gòu)均在這里。

另外在目黑區(qū)駒場(chǎng)另建一新校區(qū)，為教養(yǎng)學(xué)部及部分后勤設(shè)施所在地。附屬學(xué)校、工同研究部門(mén)，實(shí)驗(yàn)實(shí)習(xí)基地（如農(nóng)場(chǎng)、林場(chǎng)、地震、火山、天文等觀察站）、師生員工宿舍等分布于全國(guó)各地。原校本區(qū)的舊校門(mén)棗紅門(mén)所在地，原為江戶(hù)時(shí)代藩主迎接家庭成員的地方，大門(mén)被漆成朱紅色。后經(jīng)東京大地震和二次大戰(zhàn)的破壞， 1949 年被國(guó)家定為重點(diǎn)文物。 1991 年重新修繕一新，十分有氣派，現(xiàn)紅門(mén)成為東京大學(xué)的代名詞。