一、培養(yǎng)要求不同。

工學(xué)碩士：統(tǒng)招工科類研究生，側(cè)重于基礎(chǔ)理論學(xué)習(xí)和學(xué)術(shù)研究。理學(xué)碩士：專攻理科方向（如數(shù)學(xué)、物理、力學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)、天文學(xué)、地學(xué)等專業(yè)）的碩士研究生。

二、所屬科別不同。工學(xué)碩士：工學(xué)碩士招收的是工科類專業(yè)的本科生。理學(xué)碩士：理學(xué)碩士招收的是理科類專業(yè)的本科生。碩士分類學(xué)術(shù)碩士我國學(xué)術(shù)型學(xué)位按招生學(xué)科門類分為哲學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)、法學(xué)、教育學(xué)、文學(xué)、歷史學(xué)、理學(xué)、工學(xué)、藝術(shù)學(xué)、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)、軍事學(xué)、管理等13大類，13大類下面再分為88個(gè)一級(jí)學(xué)科，88個(gè)一級(jí)學(xué)科下面再細(xì)分為300多個(gè)二級(jí)學(xué)科，同時(shí)還有招生單位自行設(shè)立的760多個(gè)二級(jí)學(xué)科。碩士專業(yè)碩士學(xué)位主要包括：工商管理碩士專業(yè)學(xué)位（MBA）、公共管理碩士專業(yè)學(xué)位（MPA）、工程碩士（ME）、法律碩士（J.M）、會(huì)計(jì)碩士專業(yè)學(xué)位（MPACC）、公共衛(wèi)生碩士專業(yè)學(xué)位（MPH）、漢語國際教育碩士（MTCSOL）、農(nóng)業(yè)碩士專業(yè)學(xué)位、獸醫(yī)碩士專業(yè)學(xué)位、教育碩士專業(yè)學(xué)位、藝術(shù)碩士專業(yè)學(xué)位、體育碩士專業(yè)學(xué)位、風(fēng)景園林碩士專業(yè)學(xué)位等。專業(yè)碩士是我國研究生教育的一種形式。根據(jù)國務(wù)院學(xué)位委員會(huì)的定位，專業(yè)學(xué)位為具有職業(yè)背景的學(xué)位，培養(yǎng)特定職業(yè)高層次專門人才。