1、 中國(guó)語言文學(xué)系、歷史學(xué)系、哲學(xué)系、人類學(xué)與民族學(xué)系 ；

2、 新聞學(xué)系、廣告學(xué)系 ；

3、 英語語言文學(xué)系、歐洲語言文學(xué)系、日本語言文學(xué)系、法語語言文學(xué)系；

4、 政治學(xué)系、 公共管理系、 社會(huì)學(xué)系 ；

5、經(jīng)濟(jì)學(xué)系、計(jì)劃統(tǒng)計(jì)系、財(cái)政系、金融系、國(guó)際經(jīng)濟(jì)與貿(mào)易系 ；

6、會(huì)計(jì)學(xué)系、企業(yè)管理系、管理科學(xué)系、旅游系、工商管理教育中心（MBA中心）、高級(jí)經(jīng)理教育中心（EMBA項(xiàng)目）、廈門大學(xué)與廈門國(guó)家會(huì)計(jì)學(xué)院會(huì)計(jì)碩士專業(yè)學(xué)位聯(lián)合教育中心、物流與項(xiàng)目管理工程碩士教育中心；

7、美術(shù)系、音樂系；

8、 數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)系、信息與計(jì)算數(shù)學(xué)系 ；

9、物理學(xué)系、機(jī)電工程系 ；

10、化學(xué)系、化學(xué)工程與生物工程系、化學(xué)生物學(xué)系 ；

11、材料科學(xué)與工程系、生物材料系 ；

12、生物學(xué)系、生物化學(xué)與生物技術(shù)系、生物醫(yī)學(xué)科學(xué)系 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)系；

13、海洋學(xué)系、環(huán)境科學(xué)與工程系；

14、計(jì)算機(jī)科學(xué)系、智能科學(xué)與技術(shù)系、電子工程系、自動(dòng)化系、通信工程系 ；

15、臨床醫(yī)學(xué)系、預(yù)防醫(yī)學(xué)系、藥學(xué)系、中醫(yī)系 ；

16、建筑系、土木工程系城市規(guī)劃系

目前廈大入住翔安校區(qū)的學(xué)院有：生命科學(xué)學(xué)院，醫(yī)學(xué)院，公共衛(wèi)生學(xué)院，藥學(xué)院，海洋和地球?qū)W院，環(huán)境和生態(tài)學(xué)院，能源學(xué)院，航空航天學(xué)院，國(guó)際學(xué)院。這些學(xué)院的相關(guān)專業(yè)當(dāng)然全部都在翔安校區(qū)。