制藥工程專業(yè)主要就業(yè)方向是：藥品的創(chuàng)新性研究、藥物新產(chǎn)品開發(fā)、國內(nèi)外制藥新技術的轉(zhuǎn)化、產(chǎn)品的技術改造、醫(yī)學研究和質(zhì)量控制，或者報考生物技術、藥學及相關專業(yè)的研究生。

藥物工程專業(yè)的學生畢業(yè)后可到制藥工程（或醫(yī)藥生物技術）領域相關的生產(chǎn)企業(yè)、營銷企業(yè)、科研院所、藥品監(jiān)督管理部門、事業(yè)單位從事藥品生產(chǎn)、管理、營銷、檢驗監(jiān)督和研發(fā)工作。材料補充：制藥工程專業(yè)的考研方向分為五大類，具體介紹如下：

1、藥物化學。藥物化學屬于藥學的二級學科，本專業(yè)是培養(yǎng)能在科研與開發(fā)生產(chǎn)領域從事藥物合成、藥物設計和功能基因藥物的研究，藥品監(jiān)督和管理的高級專業(yè)人才。

2、化學工程與技術?；瘜W工程與技術專業(yè)擁有化學工程與技術及分析化學、高分子化學與物理、材料物理化學等相近學科?；瘜W工程與技術專業(yè)主要研究方向是：現(xiàn)代傳質(zhì)理論與分離工程、生物信息學與生物化工、新型催化材料與反應工程、綠色化學新工藝與產(chǎn)品工程、能源化工和環(huán)境化工、材料化工、現(xiàn)代過程系統(tǒng)工程等。

3、藥學。藥學專業(yè)培養(yǎng)具備藥學學科基本理論、基本知識和實驗技能，能在藥品生產(chǎn)、檢驗、流通、使用和研究領域從事鑒定、藥物設計、一般藥物制劑及臨床合理用藥等方面工作的高級科學技術人才。

4、中藥學。中藥學專業(yè)培養(yǎng)具備中藥學基礎理論、基本知識、基本技能以及與其相關的中醫(yī)學、藥學等方面的知識和能力，能在中藥生產(chǎn)、檢驗、流通、使用和研究與開發(fā)領域從事中藥鑒定、設計、制劑及臨床合理用藥等方面工作的高級科學技術人才。

5、其他。各院校培養(yǎng)的制藥工程專業(yè)學生在知識上為寬口徑，因此學生可結(jié)合自身情況跨專業(yè)考研。