1、古代文獻由于戰(zhàn)亂和天災而損失很多，敦煌文獻的發(fā)現(xiàn)對重新認識評價古代思想，和重新發(fā)現(xiàn)古代文化典籍，有著重要的直接的實物參考。

2、古代思想和文獻由于朝代更替和政治思想的壓制，有很多人為篡改和編造的情況，而敦煌文獻的發(fā)現(xiàn)，則有很重要的實物考據(jù)作用，發(fā)現(xiàn)哪些文獻或經(jīng)典在后代被改造，或者后代哪些文獻是被編造。

3、敦煌文獻在文物的材質上，可以考察古代科學技術水平的發(fā)展變化歷程，比如造紙、印刷等技術，一些古代文獻的記錄也對當時的政治、經(jīng)濟、科技等情況有重要的參考作用。

4、敦煌文獻多為手抄手繪，因此保留了很多古代藝術發(fā)展變化的記錄，在書法演變、繪畫題材和方法等方面都有重要的指導價值。

5、敦煌文獻的內容上除了涉及宗教，還有很多涉及當時的科技、人文、地理、政治、文學藝術等方面，甚至還可以找到與周邊各國交往的文獻，因此被稱為古代歷史文化的百科全書。