分子設(shè)計(jì)不是一門獨(dú)立的學(xué)科，也不是門獨(dú)立的技術(shù)，其設(shè)計(jì)過程是：

1. 數(shù)據(jù)收集：數(shù)據(jù)可靠性是設(shè)計(jì)的關(guān)鍵地，只有確保數(shù)據(jù)的可靠，設(shè)計(jì)的結(jié)果才有意義。

2. 確定作用機(jī)理并找出有效官能團(tuán)。

3. 參數(shù)提取與建模方法選擇：參數(shù)可以從實(shí)驗(yàn)得來，也可以是從理論計(jì)算而來。理論計(jì)算參數(shù)的優(yōu)點(diǎn)是沒有人為的影響因素。

4. 模型建立：根據(jù)前面收集到的數(shù)據(jù)、參數(shù)建立數(shù)學(xué)模型，定樣模型是分子設(shè)計(jì)的主要依據(jù)。

5. 檢驗(yàn)建立的定量模型，確保模型可信性。

6. 設(shè)計(jì)新分子。

7. 合成及性能測(cè)試：通過一定方法合成所設(shè)計(jì)的分子，并檢驗(yàn)新分子性能。并根據(jù)情況從1 - 6步進(jìn)行多輪反復(fù)。