計(jì)算機(jī)可以通過多種方式模擬生物。

通過生物物理學(xué)來模擬。這種方法通常使用大量粒子模擬技術(shù)，如蒙特卡羅模擬和分子動力學(xué)(MD)，來模擬生命體系中的自然現(xiàn)象和機(jī)制。這種方法可以使用仿真運(yùn)動模型來確定蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和定義蛋白質(zhì)對其他分子的影響。通過模擬生物化學(xué)來模擬。這種方法的目的是通過制定計(jì)算模型來指定相互作用和分子組裝的驅(qū)動方式和模式。之后，利用計(jì)算機(jī)程序開發(fā)化學(xué)反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)，從而模擬生物化學(xué)過程。通過系統(tǒng)生物學(xué)來模擬。這種方法從大量實(shí)驗(yàn)中獲得生物中各項(xiàng)參數(shù)，然后代入已知的生化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)中，模擬出小范圍的生命活動?，F(xiàn)在較好的系統(tǒng)生物學(xué)已經(jīng)可以模擬出包含幾百種DNA/RNA/蛋白質(zhì)的生化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)。需要注意的是，這些模擬方法都有一定的局限性和復(fù)雜性，不能完全替代實(shí)際的生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。而且，隨著生命科學(xué)的不斷發(fā)展，計(jì)算機(jī)模擬技術(shù)也需要不斷更新和完善，以更好地模擬生命體系的各種復(fù)雜現(xiàn)象。