湖州市博物館主要陳列主題是湖州歷史文化和自然環(huán)境，主要包含三部分。

第一部分是湖州古代文化陳列，展示了湖州境內(nèi)吳文化、越文化和宋元明清時(shí)期湖州文化的歷史文物和造型藝術(shù)。第二部分是湖州民俗文化陳列，包括節(jié)慶、民間信仰、民間工藝、民間文藝等方面的展示。第三部分是湖州自然地理陳列，展示了湖州地理環(huán)境、生物多樣性和湖州地區(qū)水利建設(shè)的歷史變遷，通過(guò)這三部分內(nèi)容的展示，著重展示了湖州地區(qū)人民的歷史文化、自然生態(tài)和物質(zhì)生活狀況。