有區(qū)別，如下：

1、培養(yǎng)方式。

專業(yè)碩士：課程設(shè)置側(cè)重實踐，教學(xué)內(nèi)容將理論和實踐有機(jī)結(jié)合，采用理論講授、案例分析、現(xiàn)場研究等多種方法教學(xué)，在具體的學(xué)習(xí)過程中，部分時間在實踐，實踐學(xué)分比重大于學(xué)術(shù)學(xué)位碩士。學(xué)術(shù)碩士：所學(xué)課程注重基礎(chǔ)理論學(xué)習(xí)，學(xué)員畢業(yè)后具備從事科學(xué)研究創(chuàng)新工作的能力和素質(zhì)。

2、招生專業(yè)。專業(yè)碩士：招生專業(yè)有針對性，有工商管理、公共管理、稅務(wù)、國際商務(wù)等，總共四十門左右。學(xué)術(shù)碩士：招生專業(yè)比較全，基本涵蓋所有專業(yè)方向，適合不同工作領(lǐng)域的人學(xué)習(xí)。

3、導(dǎo)師制度。專業(yè)碩士：實行雙導(dǎo)師制。有校內(nèi)導(dǎo)師和校外導(dǎo)師，在培養(yǎng)過程中校內(nèi)導(dǎo)師重在教授理論知識，校外導(dǎo)師以指導(dǎo)實踐為主。學(xué)術(shù)碩士：實行單導(dǎo)師制。研究生導(dǎo)師對學(xué)員讀研期間的全過程進(jìn)行指導(dǎo)，包括前期的理論學(xué)習(xí)和后期的學(xué)位論文。

4、學(xué)制學(xué)費。專業(yè)碩士：學(xué)制一般在2-3年左右，學(xué)費要比學(xué)術(shù)碩士學(xué)費高。學(xué)術(shù)碩士：學(xué)制一般是3年，學(xué)費較低，從2014年秋季學(xué)期起，原則上每年碩士生不超過8000元。

5、學(xué)位論文。專業(yè)碩士：必須強(qiáng)化應(yīng)用導(dǎo)向，形式可多種多樣?？梢圆捎谜{(diào)研報告、產(chǎn)品開發(fā)、案例分析、等多種形式撰寫。學(xué)術(shù)碩士：強(qiáng)調(diào)科學(xué)理論研究與原創(chuàng)學(xué)術(shù)創(chuàng)新，形式比較傳統(tǒng)。