上海醫(yī)科大學(xué)創(chuàng)建于1927年，是中國(guó)人自主創(chuàng)辦的第一所高等醫(yī)學(xué)院校。

建院時(shí)定名為第四中山大學(xué)醫(yī)學(xué)院，1932年改名為國(guó)立上海醫(yī)學(xué)院，1952年更名為上海第一醫(yī)學(xué)院，1959年成為全國(guó)重點(diǎn)大學(xué)，1985年改名為上海醫(yī)科大學(xué)。

2005年7月18日，上海交通大學(xué)與上海第二醫(yī)科大學(xué)合并，成立了由教育部、上海市人民政府重點(diǎn)共建的上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院，進(jìn)入“985”高校行列。

2010年11月，學(xué)院成為衛(wèi)生部與教育部合作共建的第一批十個(gè)重點(diǎn)高校中的一員。