原理
引物設(shè)計(jì)基本原理,麻煩給回復(fù)
原理
引物設(shè)計(jì)有3 條基本原
首先引物與模板的序列要緊密互補(bǔ)。
其次引物與引物之間避免形成穩(wěn)定的二聚體或發(fā)夾結(jié)構(gòu)。
再次引物不能在模板的非目的位點(diǎn)引發(fā)DNA 聚合反應(yīng)(即錯(cuò)配) 。
具體實(shí)現(xiàn)這3 條基本原則需要考慮到諸多因素,如引物長(zhǎng)度(primer length),產(chǎn)物長(zhǎng)度(productlength) ,序列Tm 值(melting temperature) ,引物與模板形成雙鏈的內(nèi)部穩(wěn)定性(internal stability ,用ΔG值反映) ,形成引物二聚體(primer dimer) 及發(fā)夾結(jié)構(gòu)(du2plex formation and hairpin) 的能值,在錯(cuò)配位點(diǎn)(falsepriming site) 的引發(fā)效率,引物及產(chǎn)物的GC 含量(composition),等等。必要時(shí)還需對(duì)引物進(jìn)行修飾,如增加限制性內(nèi)切酶位點(diǎn),引進(jìn)突變等。