1、指令性課題各級(jí)政府主管部門考慮全局或本地區(qū)醫(yī)藥衛(wèi)生事業(yè)中迫切需要解決的問題，指定有關(guān)單位或個(gè)人必須在某一時(shí)段完成某一針對(duì)性很強(qiáng)的科研任務(wù)。

這類課題具有行政命令性質(zhì)，因此稱為指令性醫(yī)學(xué)科研課題設(shè)計(jì)項(xiàng)目。這類課題的經(jīng)費(fèi)額度較大，但獲得指令性項(xiàng)目，必須具有雄厚的研究實(shí)力。如血吸蟲病防治課題，計(jì)劃生育課題等都屬此類課題。

2、指導(dǎo)性課題指導(dǎo)性課題又稱招標(biāo)性課題。國(guó)家有關(guān)部門根據(jù)醫(yī)藥衛(wèi)生科學(xué)發(fā)展的需要，制定若干科研項(xiàng)目，引入競(jìng)爭(zhēng)機(jī)制，采取公開招標(biāo)方式落實(shí)計(jì)劃。在招標(biāo)中，實(shí)行自由申報(bào)，同行專家評(píng)議，擇優(yōu)資助。盡管對(duì)指導(dǎo)性課題申請(qǐng)者的職稱要求副高以上，但只要有兩名同行專家推薦，副高以下職稱者也可能獲得中標(biāo)資格。指導(dǎo)性醫(yī)學(xué)科研課題設(shè)計(jì)主要有以下渠道。

（1）國(guó)家自然科學(xué)基金國(guó)家科技部每年度頒發(fā)招標(biāo)《項(xiàng)目指南》。有關(guān)醫(yī)藥衛(wèi)生科學(xué)的主要類別如下：

①面上項(xiàng)目：這類項(xiàng)目面廣、量大，占所有資助的大部分。內(nèi)容包括自由申請(qǐng)項(xiàng)目、青年科學(xué)基金項(xiàng)目、高技術(shù)項(xiàng)目與新概念、新構(gòu)思探索項(xiàng)目。青年科學(xué)基金項(xiàng)目鼓勵(lì)35歲以下且具有較高學(xué)位或科研能力較強(qiáng)的年青人申報(bào)醫(yī)學(xué)科研課題設(shè)計(jì)。

②重點(diǎn)項(xiàng)目：即指處于學(xué)科前沿并可能出現(xiàn)突破，具有重要意義的項(xiàng)目，此項(xiàng)目資助強(qiáng)度較大。

③重大項(xiàng)目：即指理論與應(yīng)用意義重大，目標(biāo)明確，基礎(chǔ)堅(jiān)實(shí)，可望在近期取得重大成果的項(xiàng)目。

④新醫(yī)藥基礎(chǔ)性研究基金：用以資助新醫(yī)藥前期的關(guān)鍵基礎(chǔ)性研究和實(shí)驗(yàn)。

（2）政府管理部門科研基金國(guó)家、省市及地市科技、教育、衛(wèi)生行政部門設(shè)置醫(yī)藥科學(xué)專用研究基金。主要資助應(yīng)用性醫(yī)學(xué)科研課題設(shè)計(jì)，重點(diǎn)放在常見病、多發(fā)病、地方病和職業(yè)病的防治研究。

（3）單位科研基金隨著醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的發(fā)展，各單位的市場(chǎng)意識(shí)和科研意識(shí)增強(qiáng)，均撥出一些經(jīng)費(fèi)用于科技開發(fā)。資助對(duì)象向年青人傾斜，重點(diǎn)資助起步性醫(yī)學(xué)科研課題設(shè)計(jì)，為下一步申請(qǐng)國(guó)家及與省級(jí)課題奠定基礎(chǔ)。

3、委托課題委托課題來自于各級(jí)主管部門、大型廠礦企業(yè)和公司，委托單位的目的是看中受托單位的技術(shù)力量和設(shè)備優(yōu)勢(shì)，研制某項(xiàng)新產(chǎn)品、新技術(shù)和新方法，或測(cè)試分析某些產(chǎn)品的成份。某些跨國(guó)公司利用我國(guó)的資源，加大了在我國(guó)醫(yī)學(xué)藥學(xué)的研究投入，資助的力度較大。

4、自選課題臨床醫(yī)學(xué)工作者，可以按照個(gè)人的專長(zhǎng)與經(jīng)驗(yàn)，在自己崗位上根據(jù)本人或單位的需要與可能，自由地選擇研究課題。在基層單位，自選課題大有潛力可挖。例如試用一個(gè)新藥治療某病，就可有意識(shí)地比較新藥與原有同類藥物療效和副作用的差異，也可研究該藥與其它西藥或中藥聯(lián)合用藥的效應(yīng)，還可研究該藥療效與不同性別、年齡段、病情、療程的關(guān)系…… 總之，只要開動(dòng)腦筋，臨床醫(yī)學(xué)工作中的醫(yī)學(xué)科研課題設(shè)計(jì)是大有選擇空間的。