系和學(xué)院的區(qū)別主要在于：從屬關(guān)系不同、規(guī)模不同、功能不同。

一、從屬關(guān)系不同。系和學(xué)院二者之間是從屬關(guān)系。學(xué)院包含了系屬于多個系的集合。一個學(xué)院中有很多個系，表示著某個專業(yè)方向的綜合；而一個系則有很多個專業(yè)，表示著某個專業(yè)方向的類別。拿機電方向舉例，“機電和自動化學(xué)院下包含了電氣系、機電系、自動化系等”這個例子很清楚地表明了學(xué)院與系之間的關(guān)系。

二、規(guī)模不同。在規(guī)模上，從專業(yè)設(shè)置數(shù)量、學(xué)院師生人數(shù)，再到設(shè)備設(shè)施和建筑占地面積，學(xué)院總體來說是大于系科的。上世紀(jì)80年代以來，一批規(guī)模較大、辦學(xué)水平較高的教學(xué)科研型或研究型大學(xué)，紛紛由學(xué)系改組成為學(xué)院，升級的基本條件之一就是對學(xué)院規(guī)模有一定要求，如招生規(guī)模、教師數(shù)量和比例、實驗室硬件設(shè)施、有碩士學(xué)科點、國家實驗室、畢業(yè)生的論文水平和存檔情況等，達到一定規(guī)模的基礎(chǔ)上才可以從系科升級為二級學(xué)院。

三、功能及承擔(dān)的任務(wù)不同。大學(xué)的系科主要承擔(dān)組織教學(xué)和人才培養(yǎng)，具體科研項目及實驗室建設(shè)等任務(wù)。當(dāng)系升級為二級學(xué)院后，以學(xué)院為主體，其所具有的功能和承擔(dān)的任務(wù)都有了更大的外延，擴展到高層次人才培養(yǎng)、學(xué)科建設(shè)、科學(xué)研究及科技開發(fā)等領(lǐng)域，并因涵蓋領(lǐng)域的擴大，不斷形成交叉學(xué)科、邊緣學(xué)科、新興學(xué)科，通過創(chuàng)新學(xué)科，促進社會和經(jīng)濟發(fā)展。