有微生物生態(tài)學(xué)、植物生態(tài)學(xué)、動(dòng)物生態(tài)學(xué)、人類生態(tài)學(xué)等。

有:個(gè)體生態(tài)學(xué)、種群生態(tài)學(xué)、群落生態(tài)學(xué),生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)學(xué)等。有陸地生態(tài)學(xué)和水域生態(tài)學(xué)；前者又可分為森林生態(tài)學(xué)、草原生態(tài)學(xué)、荒漠生態(tài)學(xué)、土壤生態(tài)學(xué)等，后者可分為海洋生態(tài)學(xué)、湖沼生態(tài)學(xué)、流域生態(tài)學(xué)等；還有更細(xì)的劃分，如:植物根際生態(tài)學(xué)、腸道生態(tài)學(xué)等。生態(tài)學(xué)與非生命科學(xué)相結(jié)合的，有數(shù)學(xué)生態(tài)學(xué)、化學(xué)生態(tài)學(xué)、物理生態(tài)學(xué)、地理生態(tài)學(xué)、經(jīng)濟(jì)生態(tài)學(xué)、生態(tài)經(jīng)濟(jì)學(xué)、森林生態(tài)會(huì)計(jì)等；與生命科學(xué)其他分支相結(jié)合的有生理生態(tài)學(xué)、行為生態(tài)學(xué)、遺傳生態(tài)學(xué)、進(jìn)化生態(tài)學(xué),古生態(tài)學(xué)等。應(yīng)用性分支學(xué)科有：農(nóng)業(yè)生態(tài)學(xué)、醫(yī)學(xué)生態(tài)學(xué)、工業(yè)資源生態(tài)學(xué)、環(huán)境保護(hù)生態(tài)學(xué)、環(huán)境生態(tài)學(xué)、生態(tài)保育、生態(tài)信息學(xué)、城市生態(tài)學(xué)、生態(tài)系統(tǒng)服務(wù)、景觀生態(tài)學(xué)等。