生物信息學(xué)的發(fā)展經(jīng)歷了3個(gè)階段。

第一個(gè)階段是前基因組時(shí)代。這一階段主要是以各種算法法則的建立、生物數(shù)據(jù)庫(kù)的建立以及DNA和蛋白質(zhì)序列分析為主要工作；第二階段是基因組時(shí)代。這一階段以各種基因組計(jì)劃測(cè)序、網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)的建立和基因?qū)ふ覟橹饕ぷ?。第三階段是后基因組時(shí)代。這一階段的主要工作是進(jìn)行大規(guī)?；蚪M分析、蛋白質(zhì)組分析以及其他各種基因組學(xué)研究。