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代謝組學(xué)怎么篩選差異代謝物質(zhì)

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問題描述:

代謝組學(xué)怎么篩選差異代謝物質(zhì),麻煩給回復(fù)

最佳答案

推薦答案

代謝組學(xué)篩選差異代謝物質(zhì)一般有以下幾個(gè)步驟:

1. 樣本采集:采集不同生理狀態(tài)的樣本,例如對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組等。

2. 樣本處理:對(duì)樣本進(jìn)行預(yù)處理,包括樣本提取、樣本轉(zhuǎn)化、樣本清潔、代謝物分離等。

3. 質(zhì)譜分析:用質(zhì)譜對(duì)樣本中的代謝物進(jìn)行分析,一般采用液質(zhì)聯(lián)用或氣質(zhì)聯(lián)用的技術(shù)。

4. 數(shù)據(jù)處理:將質(zhì)譜分析的結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,分析不同樣本中代謝物的數(shù)量和變化趨勢(shì)。

5. 差異代謝物篩選:利用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選出在不同樣本中特異性增加或減少的代謝物。常用的方法包括t-test、方差分析(ANOVA)、多重假設(shè)校正等。

6. 生物信息學(xué)分析:對(duì)篩選出的差異代謝物進(jìn)行生物信息學(xué)分析和注釋,尋找其代謝途徑及生物學(xué)功能。需要注意的是,差異代謝物的篩選過程中需要注意控制誤差,如樣本預(yù)處理和技術(shù)重復(fù)性等。同時(shí),為了避免漏診或誤診,建議采用多種方法進(jìn)行篩選,并對(duì)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。

代謝組學(xué)怎么篩選差異代謝物質(zhì)

其他答案

代謝組學(xué)通常使用統(tǒng)計(jì)方法來篩選差異代謝物質(zhì)。一般來說,可以采用單變量分析(如t檢驗(yàn))或多變量分析(如主成分分析、偏最小二乘法回歸等)來鑒定在不同條件下顯著變化的代謝物。同時(shí)也需要進(jìn)行多重比較校正和驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)以保證結(jié)果的可靠性。

其他答案

代謝組學(xué)可以通過以下三步驟來篩選差異代謝物質(zhì):明確結(jié)論+原因+1. 篩選代謝物:第一步是通過代謝組學(xué)技術(shù)手段如質(zhì)譜或核磁共振等,對(duì)研究對(duì)象的生物體液、組織、細(xì)胞等進(jìn)行代謝物的篩選和檢測(cè)。

2. 鑒定差異代謝物:第二步是對(duì)篩選得到的代謝物進(jìn)行差異分析,確定其中具有顯著差異性的分子,這些分子即為差異代謝物。

3. 分析差異代謝物:第三步是對(duì)差異代謝物進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析、生物學(xué)功能的鑒定和途經(jīng)分析,深入探究它們?cè)谏飳W(xué)系統(tǒng)中調(diào)節(jié)和影響的機(jī)理,以期更深層次地疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制。因此,代謝組學(xué)通過上述步驟在分子層面上為疾病的早期診斷、評(píng)估和分子機(jī)制研究提供了重要工具和手段。

其他答案

方法主要有以下三種:

1.

倍數(shù)變化法(FC值)

2.

T檢驗(yàn)法(P值、FDR值)

3.

(O)PLS-DA法(VIP值) 一、倍數(shù)變化發(fā) 倍數(shù)變化法即根據(jù)代謝物的相對(duì)定量或絕對(duì)定量結(jié)果,計(jì)算某個(gè)代謝物在兩組間表達(dá)量的差異倍數(shù)(Fold Change),簡(jiǎn)稱FC值。假設(shè)A物質(zhì)在對(duì)照組中定量結(jié)果為1,在疾病組中定量結(jié)果為3,那么此物質(zhì)的FC值即為3。

其他答案

1

將待測(cè)樣本用4℃預(yù)冷的pbs清洗2次,加入超純水勻漿,渦旋,加入提取液,渦旋,超聲破碎2次,沉淀,離心,將上清冷凍干燥后得到粉狀代謝混合物,將代謝混合物于-80℃下凍存,備用;

2

先將第一步凍存的代謝混合物復(fù)溶...

3

確定每種代謝物質(zhì);

4

篩選顯著性差異代謝物質(zhì)。

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