代謝組學(xué)篩選差異代謝物質(zhì)一般有以下幾個(gè)步驟:
1. 樣本采集:采集不同生理狀態(tài)的樣本,例如對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組等。
2. 樣本處理:對(duì)樣本進(jìn)行預(yù)處理,包括樣本提取、樣本轉(zhuǎn)化、樣本清潔、代謝物分離等。
3. 質(zhì)譜分析:用質(zhì)譜對(duì)樣本中的代謝物進(jìn)行分析,一般采用液質(zhì)聯(lián)用或氣質(zhì)聯(lián)用的技術(shù)。
4. 數(shù)據(jù)處理:將質(zhì)譜分析的結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,分析不同樣本中代謝物的數(shù)量和變化趨勢(shì)。
5. 差異代謝物篩選:利用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選出在不同樣本中特異性增加或減少的代謝物。常用的方法包括t-test、方差分析(ANOVA)、多重假設(shè)校正等。
6. 生物信息學(xué)分析:對(duì)篩選出的差異代謝物進(jìn)行生物信息學(xué)分析和注釋,尋找其代謝途徑及生物學(xué)功能。需要注意的是,差異代謝物的篩選過程中需要注意控制誤差,如樣本預(yù)處理和技術(shù)重復(fù)性等。同時(shí),為了避免漏診或誤診,建議采用多種方法進(jìn)行篩選,并對(duì)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。