生物工程包括五大工程，即遺傳工程、細胞工程、微生物工程、酶工程和生物反應(yīng)器工程。

(一)遺傳工程，是將生物特定的基因按照人的意愿經(jīng)過體外重組后再轉(zhuǎn)入生物體內(nèi)，使這個基因能在受體生物內(nèi)復制、轉(zhuǎn)錄、翻譯、表達，從而產(chǎn)生出人們所期望的產(chǎn)物或達到某種目的?；蚬こ套罱K改變的是生物的遺傳物質(zhì)。(二)細胞工程是指應(yīng)用細胞生物學和分子生物學的方法，通過類似于工程學的步驟在細胞整體水平或細胞器水平上，遵循細胞的遺傳和生理活動規(guī)律，有目的地制造細胞產(chǎn)品的一門生物技術(shù)。是通過細胞融合、核移植、細胞器移植或染色體操作，產(chǎn)生雜種細胞并發(fā)育成個體的技術(shù)。(三)發(fā)酵工程利用微生物生長速度快,生長條件簡單以及新陳代謝過程特殊等特點，在合適條件下,通過現(xiàn)代工程技術(shù)手段,由微生物的某種特定功能生產(chǎn)出人類所需的產(chǎn)品稱為發(fā)酵工程,有時也成微生物工程.(四)酶工程是利用酶、細胞器或細胞所具有的特異催化功能,借助生物反應(yīng)裝置和工藝過程來生產(chǎn)人類所需產(chǎn)品的一項技術(shù),包括酶的固定化技術(shù)、細胞的固定化技術(shù)、酶的修飾改造化技術(shù)及酶反應(yīng)的設(shè)計等技術(shù)。在這五大領(lǐng)域中，前兩者作用是將常規(guī)菌作為特定遺傳物質(zhì)受體，使它們獲得外來基因，成為能表達超遠緣性狀的新物種——工程菌或工程細胞株。后三者的作用則是這一有巨大潛在價值的新物種創(chuàng)造良好的生長與繁殖條件，進行大規(guī)模的培養(yǎng)，以充分發(fā)揮其內(nèi)在潛力，為人們提供巨大的經(jīng)濟效益和社會效益。