福建醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院分為直屬附屬醫(yī)院和非直屬附屬醫(yī)院，一、直屬附屬醫(yī)院：福建醫(yī)科大學(xué)附屬協(xié)和醫(yī)院、福建醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院。

福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院、福建醫(yī)科大學(xué)附屬第三醫(yī)院（建設(shè)中）、福建醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院、福建醫(yī)科大學(xué)附屬平潭協(xié)和醫(yī)院（建設(shè)中）。

二、非直屬附屬醫(yī)院：省立臨床醫(yī)學(xué)院（省立醫(yī)院）、?？偱R床醫(yī)學(xué)院（福州總醫(yī)院）、 福建醫(yī)科大學(xué)附屬漳州市醫(yī)院、福建醫(yī)科大學(xué)附屬泉州第一醫(yī)院、福建醫(yī)科大學(xué)附屬三明第一醫(yī)院、 福建醫(yī)科大學(xué)附屬龍巖第一醫(yī)院、孟超肝膽醫(yī)院、福建醫(yī)科大學(xué)附屬閩東醫(yī)院。福建醫(yī)科大學(xué)附屬南平第一醫(yī)院、福建醫(yī)科大學(xué)附屬福州市第一醫(yī)院、武警福建總隊醫(yī)院、福建醫(yī)科大學(xué)附屬寧德市醫(yī)院、福建省婦幼保健院、福建省腫瘤醫(yī)院。

三、福建醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院三甲醫(yī)院：福建醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院、福建醫(yī)科大學(xué)附屬協(xié)和醫(yī)院、省立醫(yī)院。福建醫(yī)科大學(xué)創(chuàng)建于1937年，前身為福建省立醫(yī)學(xué)?？茖W(xué)校，是我國建校較早的醫(yī)學(xué)院校之一。學(xué)校是一所以醫(yī)為主，多學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展，具有完整人才培養(yǎng)體系的福建省“雙一流”建設(shè)高校，是福建省衛(wèi)生人才培養(yǎng)中心、醫(yī)學(xué)科學(xué)研究中心和醫(yī)療衛(wèi)生服務(wù)中心。