轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫是什么意思希望能解答下
小白留學(xué)
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2024-08-02 19:58:21
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫的意思是:對經(jīng)過不同類型試劑(小分子化合物為主)處理的細(xì)胞系進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組層面的測序，分析這些試劑所造成的相對于正常細(xì)胞系的差異基因圖譜。
并基于差異基因結(jié)果，提供一系列后續(xù)分析方案。而CMAP(CONNECTIVITY MAP)正是LINCS Center for Transcriptomics at the Broad Institute(cellular phenotype→轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平)，使用L1000測序方法建立起來的數(shù)據(jù)庫。
李麗Sara留學(xué)
留學(xué)咨詢，傳夢為樂。
2024-08-02 19:58:21
轉(zhuǎn)錄組（transcriptome）數(shù)據(jù)庫廣義上指某一生理?xiàng)l件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRNA的集合。
轉(zhuǎn)錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶（oligo-dT）進(jìn)行親和純化的RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄生成的成熟mRNA和ncRNA進(jìn)行高通量測序。
小英話留學(xué)
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2024-08-02 19:58:21
轉(zhuǎn)錄組測定的是在某個(gè)特定樣品里表達(dá)的基因的豐度及其類型(例如可變剪接)。
藝術(shù)留學(xué)大表哥
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