萊頓大學(xué)擁有超過五十個(gè)研究機(jī)構(gòu)，其中有些完全隸屬于該校的某個(gè)學(xué)院，其余則是院際或校際機(jī)構(gòu)。

大部分荷蘭學(xué)者都與其中某些機(jī)構(gòu)相關(guān)。下設(shè)機(jī)構(gòu)有：ASC非洲研究中心CNWS亞洲、非洲與美洲研究所CRC危機(jī)研究中心CTI語(yǔ)言與認(rèn)同研究中心M. Meijers 研究所法學(xué)研究所Grotius 中心國(guó)際法學(xué)研究中心GSS萊頓科學(xué)研究所史學(xué)研究所史學(xué)研究所Huizinga 研究所文化史研究所IBL萊頓生物研究所IIAS區(qū)域研究所IOPS心理計(jì)量與社會(huì)計(jì)量學(xué)校際研究所ISED教育與人力發(fā)展研究所LACDR萊頓—阿姆斯特丹藥物研究中心LCMBS萊頓分子生物學(xué)中心LGSAS萊頓考古學(xué)研究所LIACS萊頓進(jìn)階計(jì)算機(jī)科學(xué)研究所LIC萊頓化學(xué)研究所LION萊頓物理研究所LISOR萊頓宗教研究所LUCL萊頓大學(xué)語(yǔ)言學(xué)中心LUMI萊頓大學(xué)數(shù)學(xué)研究所Mediëvistiek荷蘭中世紀(jì)研究所NIG荷蘭管理研究所NOVA荷蘭天文研究所W. Posthumus Instituut荷蘭經(jīng)濟(jì)暨社會(huì)史研究所OIKOS國(guó)立古典研究所Onderzoekschool Kunstgeschiedenis荷蘭藝術(shù)史研究所OSL荷蘭文學(xué)研究所PALLAS西方藝術(shù)暨文學(xué)史研究所萊頓天文臺(tái)萊頓天文臺(tái)歐洲研究所關(guān)于歐洲整合領(lǐng)域的法學(xué)研究所Van Vollenhoven 研究所法律、管理與發(fā)展研究所