京都大學起源于1861年（文久元年），原是在長崎設立的長崎養(yǎng)生所（之后改稱為長崎精得館）。
京都大學是繼東京大學成立之后的第二所日本國立大學，創(chuàng)建于1897年，最初名為京都帝國大學；二戰(zhàn)后，正式更名為“京都大學”；2004年改組為國立大學法人京都大學。在2018與2019年泰晤士高等教育日本大學排名中，京都大學位列日本第1位；位列2019世界大學學術排名全球第32位，日本第2位，在其自然科學和生命科學領域均位列全球第21位；位列2021QS世界大學排名世界第38位。
