如果在審核材料過程中，將真實的學歷認定為造假，相關責任人應當承擔相應的法律責任。

具體處理方法如下：

1. 追究責任：對于故意或者過失將真實學歷認定為造假的審核人員，應當根據(jù)其行為性質(zhì)和情節(jié)輕重，給予相應的黨紀、政紀處分或者法律處罰。

2. 恢復名譽：對于被誤認為學歷造假的人員，應當及時恢復其名譽，撤銷對其的處罰決定，并公開道歉。同時，對于在審核過程中造成的損失，應當給予相應的賠償。

3. 完善制度：為了避免類似問題再次發(fā)生，應當加強對審核人員的培訓和教育，提高其業(yè)務水平和責任心。同時，完善審核制度，確保審核過程的嚴謹性和準確性。

4. 加強監(jiān)督：加強對審核工作的監(jiān)督，確保審核過程的公開透明，防止權力濫用和腐敗現(xiàn)象的發(fā)生。對于發(fā)現(xiàn)的問題，要及時整改，確保審核結(jié)果的真實性和公正性?？傊?，對于審核材料把真學歷認定為造假的情況，應當追究相關責任人的法律責任，恢復被誤認為學歷造假人員的名譽，并加強制度建設和監(jiān)督，防止類似問題再次發(fā)生。