1、概念不同：工學(xué)碩士是指全日制統(tǒng)招工科類研究生，側(cè)重于基礎(chǔ)理論學(xué)習(xí)和學(xué)術(shù)研究；理學(xué)碩士是對(duì)碩士研究生專攻理科方向（如數(shù)學(xué)、物理、力學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)、天文學(xué)、地學(xué)等專業(yè)）的學(xué)生的一種專業(yè)上的稱謂。

2、招生不同：工學(xué)碩士招收的是工科類專業(yè)的本科生；理學(xué)碩士招收的是理科類專業(yè)的本科生。

3、培養(yǎng)方向不同：工學(xué)碩士培養(yǎng)具有扎實(shí)理論基礎(chǔ)和實(shí)踐能力的應(yīng)用型專門(mén)人才；理學(xué)碩士專門(mén)用于培養(yǎng)理科方面的人才。