日本果樹以柑橘的栽培面積最大，其次是蘋果，然后依次是柿、板栗、葡萄、梅、日本梨、桃。

蘋果最大產(chǎn)區(qū)是青森縣（53.6%），其次是長野縣（20.2%）；葡萄主產(chǎn)區(qū)為山梨縣（22.4%）和長野縣（12.8%）；日本梨主產(chǎn)區(qū)為千葉縣（11.9%）和茨城縣（9.4%）；西洋梨主產(chǎn)區(qū)為山形縣（58.5%）和青森縣（8.4%）；桃主產(chǎn)區(qū)為山梨縣（32.4%）和福島縣（16.3%）；李主產(chǎn)區(qū)為山梨縣（29.6%）和長野縣（13.0%）；櫻桃主產(chǎn)區(qū)為山形縣（65.2%）和北海道（11.9%）；梅和柿主要集中在和歌山。