復(fù)旦大學(xué)圖書館是國家古籍重點(diǎn)保護(hù)單位，中國高校圖書情報(bào)工作指導(dǎo)委員會副主任委員館，中國高校人文社會科學(xué)文獻(xiàn)中心（CASHL）兩個全國中心館之一。

設(shè)有教育部面向全國和華東地區(qū)的外國教材中心，教育部文科外文圖書引進(jìn)中心書庫、歐盟圖書專架、教育部科技查新工作站（綜合類）、上海市科委科技查新站（計(jì)算機(jī)與生物）、全國醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索教學(xué)研究會理事長館兼秘書處、圖書館學(xué)碩士培養(yǎng)點(diǎn)、中國索引學(xué)會秘書處，并承擔(dān)了《中國索引》和《上海高校圖書情報(bào)工作研究》兩份雜志的編輯出版工作。 1918年由學(xué)生集資購書成立的戊午閱書社是復(fù)旦大學(xué)圖書館的前身。復(fù)旦大學(xué)圖書館現(xiàn)由文科館、理科館、醫(yī)科館、張江館、江灣館（李兆基圖書館）、古籍部（國家古籍重點(diǎn)保護(hù)單位）組成。

2000年4月27日，上海醫(yī)科大學(xué)與復(fù)旦大學(xué)合并，原上海醫(yī)科大學(xué)圖書館改為"復(fù)旦大學(xué)圖書館醫(yī)科館"。